L'église Saint Jacques de Latour Bas Elne est un édifice à nef unique, terminé par une abside romane semi-circulaire à l’est, comportant une fenêtre à double ébrasement de la même époque. Le vaisseau est bordé de quatre chapelles latérales construites postérieurement. Les deux premières, rajoutées probablement à la fin du moyen-âge, sont ouvertes sur la nef par deux grands arcs-brisés, construits en cairous à bords chanfreinés. Les deux autres chapelles, aux arcs voûtés en berceau ont été édifiées plus tardivement, certainement au 19e siècle, comme en témoigne l'inscription figurant dans la première chapelle droite : "Chapelle construite aux frais de Mr François Vidal 1857". 
On accède à l'édifice du côté sud, par une porte en plein cintre. L'entrée primitive se situait sur la façade ouest, édifiée avec des cairous à bords chanfreinés et voûtée en berceau. Elle a été murée lors de la construction de la tribune. Sur cette même face, se dresse au faîte de la toiture, un clocheton arcade du 19e siècle, à baie unique en plein cintre, aujourd'hui sans cloche.

A l'opposé, un majestueux clocher tour semi-circulaire et plat d’un côté, s’élève sur l’abside romane de l’église. Plusieurs étapes de constructions sont à observer.
Au départ, il s’agissait d’une tour de défense, remontant au XIII° siècle, comme en témoigne la présence de sa bretèche, en saillie du côté nord. Elle faisait partie de l’ancien système de défense du village, et ses ouvertures sont des anciennes meurtrières, orientées vers la mer (est) et le sud. Cette tour de défense est l’héritière de l’ancienne tour, citée dès le X° siècle dans les manuscrits. Elle s'inscrivait dans la Cellera, cet espace protégé situé autour de l'église, à l'abri des exactions seigneuriales. Cette fortification finit par être considérée comme véritable château ("castrum de Turri": le château de La Tour) au XII° siècle, dans l'acte de donation de "la paroisse Saint Jacques de La Tour", l’an 1139.  Mais en 1501, un document évoque le "castrum" détruit de La Tour. La base du clocher-tour apparaît aujourd'hui comme l'un des derniers vestiges.
A une période imprécise (XVI° siècle ?), cette tour fut tranformée en clocher mur, grâce à un exhaussement réalisé sur le côté ouest de la tour (au niveau de l’arc triomphal). De forme pyramidale, il était percé de deux baies en plein cintre qui abritaient les cloches. Ces deux ouvertures sont encore visibles dans le clocher, elles ont été simplement obstruées par des volets, de façon à servir de bouches d’aération. La forme initiale de ce clocher-mur peut être observée sur la magnifique bannière du Secours Mutuel, datée de 1899 et conservée à l'intérieur de l'église.

Enfin, en 1901, le Conseil Municipal décida d’installer une horloge. C’est à cette période que le clocher mur fut transformé en clocher tour de plan semi-circulaire, au couronnement décoré d'un faux mâchicoulis et surmonté d'une cage en fer forgé, coiffée d’une girouette. Elle contient trois cloches en bronze, servant pour le culte et l’horloge. Au dernier étage du clocher, plusieurs cadrans d’horloge furent installés, pour que l'heure soit visible par l'ensemble des habitants de la commune.
L’édifice est composé d'un appareil de galets et de cairous, avec un chaînage d’angle en pierre de taille. Il est couvert de toitures à deux pentes. Avant de faire l'objet de grands travaux d'embellissement des murs extérieurs en 1999-2000, un épais enduit peint en blanc recouvrait l’église et le clocher. Depuis, les différentes étapes de constructions et de restaurations sont visibles. Cet édifice longtemps jugé du XIX° siècle, à cause de son ancien aspect extérieur, laisse enfin apparaître ses origines romanes.
A la fin de l'année 2005, c'est l'intérieur de l'église qui fut restauré entièrement (enduits, électricité, chauffage, conservation des objets mobiliers ...).